Tito Damiani

All publications

Latest publications

Computational metabolomics reveals overlooked chemodiversity of alkaloid scaffolds in Piper fimbriulatum

T. Damiani J. Smith T. Hebra M. Perković M. Čičak A. Kadlecová V. Rybka M. Dračínský T. Pluskal

The Plant Journal 124 (5): e70086 (2025)

MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration

M. M. Zdouc K. Blin N. L. L. Louwen J. Navarro C. Loureiro C. D. Bader C. B. Bailey L. Barra T. J. Booth K. A. J. Bozhueyuek J. D. D. Cediel-Becerra Z. Charlop-Powers M. G. Chevrette Y. H. Chooi P. M. D'Agostino T. de Rond E. Del Pup K. R. Duncan W. Gu N. Hanif E. J. N. Helfrich M. Jenner Y. Katsuyama A. Korenskaia D. Krug T. Damiani T. Hebra L. Sehnal T. Weber M. H. Medema

Nucleic Acids Research 53 (1): D678-D690 (2025)

Statistical analysis of feature-based molecular networking results from non-targeted metabolomics data

A. K. Pakkir Shah A. Walter F. Ottosson F. Russo M. Navarro-Diaz J. Boldt J. J. Kalinski E. E. Kontou J. Elofson A. Polyzois C. González-Marín S. Farrell M. R. Aggerbeck T. Pruksatrakul N. Chan Y. Wang M. Pöchhacker C. Brungs B. Cámara A. M. Caraballo-Rodriguez A. Cumsille F. de Oliveira K. Dührkop Y. El Abiead C. Geibel L. G. Graves M. Hansen S. Heuckeroth S. Knoblauch A. Kostenko M. C. M. Kuijpers K. Mildau S. Papadopoulos Lambidis P. W. Portal Gomes T. Schramm K. Steuer-Lodd P. Stincone S. Tayyab G. A. Vitale B. C. Wagner S. Xing M. T. Yazzie S. Zuffa M. de Kruijff C. Beemelmanns H. Link C. Mayer J. J. J. van der Hooft T. Damiani T. Pluskal P. Dorrestein J. Stanstrup R. Schmid M. Wang A. Aron M. Ernst D. Petras

Nature Protocols 20: 92–162 (2025)

Reproducible mass spectrometry data processing and compound annotation in MZmine 3

S. Heuckeroth T. Damiani A. Smirnov O. Mokshyna C. Brungs A. Korf J. Smith P. Stincone L. Nothias T. Hyötyläinen M. Orešič U. Karst P. C. Dorrestein D. Petras X. Du J. J. J. van der Hooft R. Schmid T. Pluskal

Nature Protocols 19: 2597–2641 (2024)