Tomáš Pluskal

All publications

Latest publications

Rapid MALDI-MS/MS-Based Profiling of Lipid A Species from Gram-Negative Bacteria Utilizing Trapped Ion Mobility Spectrometry and mzmine

E. Rudt M. Froning S. Heuckeroth L. Ortmann J. Diemand L. Hörnschemeyer A. Pleger M. Vinzelberg R. Schmid T. Pluskal U. Dobrindt H. Hayen A. Korf

Analytical Chemistry 2025: Early View

Computational metabolomics reveals overlooked chemodiversity of alkaloid scaffolds in Piper fimbriulatum

T. Damiani J. Smith T. Hebra M. Perković M. Čičak A. Kadlecová V. Rybka M. Dračínský T. Pluskal

The Plant Journal 124 (5): e70086 (2025)

Discovery of metabolites prevails amid in-source fragmentation

Y. El Abiead A. Rutz S. Zuffa B. Amer S. Xing C. Brungs R. Schmid M. S. P. Correia A. M. Caraballo-Rodriguez A. Zarrinpar H. Mannochio-Russo M. Witting I. Mohanty T. Pluskal W. Bittremieux R. Knight A. D. Patterson J. J. J. van der Hooft S. Böcker W. B. Dunn R. G. Linington D. S. Wishart J. Wolfender O. Fiehn N. Zamboni P. C. Dorrestein

Nature Metabolism 2025: Early View

Statistical analysis of feature-based molecular networking results from non-targeted metabolomics data

A. K. Pakkir Shah A. Walter F. Ottosson F. Russo M. Navarro-Diaz J. Boldt J. J. Kalinski E. E. Kontou J. Elofson A. Polyzois C. González-Marín S. Farrell M. R. Aggerbeck T. Pruksatrakul N. Chan Y. Wang M. Pöchhacker C. Brungs B. Cámara A. M. Caraballo-Rodriguez A. Cumsille F. de Oliveira K. Dührkop Y. El Abiead C. Geibel L. G. Graves M. Hansen S. Heuckeroth S. Knoblauch A. Kostenko M. C. M. Kuijpers K. Mildau S. Papadopoulos Lambidis P. W. Portal Gomes T. Schramm K. Steuer-Lodd P. Stincone S. Tayyab G. A. Vitale B. C. Wagner S. Xing M. T. Yazzie S. Zuffa M. de Kruijff C. Beemelmanns H. Link C. Mayer J. J. J. van der Hooft T. Damiani T. Pluskal P. Dorrestein J. Stanstrup R. Schmid M. Wang A. Aron M. Ernst D. Petras

Nature Protocols 20: 92–162 (2025)