Bio/chemoinformatik (ž/m)
Popis pozice
Skupina biochemické farmakologie je servisní jednotkou (Core Facility) podporující vědce z ÚOCHB především (ale nejen) v časných fázích vývoje potenciálních léčiv. Specializujeme se na vývoj testů, biologický screening, validaci cílových struktur a ADME charakterizaci látek, přičemž naše aktivní projekty pokrývají oblasti onkologie, antiinfektiv a neurofarmakologie.
Díky rozšiřujícím se možnostem v oblasti miniaturizace testů, automatizace a formátů bohatých na data se dostáváme do bodu, kdy potřebujeme systémovou i operativní pomoc při zpracovávání dat (vyhodnocování, reporting).
Vaše role a profil:
Hledáme specialist(k)u na bio/chemoinformatiku, který/á bude podporovat naše projekty prostřednictvím skriptování a programování, zpracování dat a integrace systémů. Kromě práce pro výzkumný tým bude kandidát/ka úzce spolupracovat také s týmem datového managementu ústavu (data steward, data koordinátor) při nastavování a rozvoji procesů správy a integrace dat.
Požadavky
Očekáváme:
- skriptování/programování v jazyce Python a R
- schopnost transformovat skripty do podoby webových aplikací (Flask, Vue) a jejich nasazování přes Docker
- zkušenosti s databázemi (PostgreSQL)
- integrace systémů přes REST API, např. propojení na elektronické laboratorní deníky (ELN)
- proaktivní a systematický přístup, schopnost pracovat samostatně i v týmu a ochotu pomáhat při automatizaci procesů
- základní znalost práce a údržby datových úložišť (NAS, Synology, S3) – výhodou
- znalost softwaru KNIME Analytics Platform a práce s ním - výhodou
- zkušenost s prací v laboratoři biologického směru a ochota zapojit se do laboratorní práce – výhodou
Nabízíme
- práci v odborně stimulujícím prostředí
- možnost profesního růstu a dalšího vzdělávání
- zázemí špičkové výzkumné instituce
- přátelskou a kolegiální atmosféru
- jedinečnou příležitost podílet se na modernizaci procesů v oblasti nakládání s daty
- 5 týdnů dovolené + 4 dny osobního volna
- finanční podpora pro rodiče s dětmi do 4 let věku, kteří se vrací po mateřské / rodičovské dovolené
- zaměstnanecké benefity (příspěvek na stravování, restaurace v budově ÚOCHB, příspěvek na penzijní připojištění / volnočasové aktivity, Multisport karta, zvýhodněné jazykové vzdělávání)
Dodatečné informace
zaměstnání na plný úvazek
pracovní poměr na 1 rok s možnosti prodloužení
nástup k 1.1.2026, případně i dříve
Jak se přihlásit
Strukturovaný životopis a motivační dopis zašlete dr. Heleně Mertlíkové Kaiserové na email: helena.kaiserova @ uochb.cas.cz.
Došlé přihlášky budeme přijímat a vyhodnocovat, dokud nebude pozice obsazena.