Ap4A-čepičkovaná RNA: nová úroveň regulace genové exprese

Nedávný objev netradičních RNA čepiček, jako jsou NAD a CoA, zásadně změnil pohled na strukturní a funkční diverzitu RNA ve všech typech buněk. V naší laboratoři jsme nedávno identifikovali nový typ RNA čepičky v savčích buňkách – diadenosin tetrafosfát (Ap4A). Ap4A je již několik desetiletí znám jako intracelulární signalizační molekula, jeho funkce v kontextu RNA však dosud nebyla popsána.

Naše předběžné výsledky ukazují, že RNA nesoucí Ap4A čepičku není za standardních podmínek translatována. Současně jsme díky nově vyvinuté sekvenační metodě prokázali přítomnost Ap4A na mRNA, tedy na kódujících RNA. Tyto poznatky naznačují, že Ap4A-čepičkovaná mRNA může představovat novou regulační vrstvu genové exprese, případně že Ap4A slouží jako přechodná struktura, která je následně odstraněna a nahrazena kanonickou čepičkou.

Pomocí proteomické analýzy jsme dále identifikovali soubor proteinů, které specificky interagují s Ap4A-RNA, což naznačuje existenci dosud neznámého regulačního mechanismu. Cílem této disertační práce bude objasnit biologickou roli Ap4A-RNA prostřednictvím detailního studia interakcí mezi Ap4A-RNA a jejími vazebnými proteiny, a to jak in vitro, tak in cellulo.

Studijní program: Vývojová a buněčná biologie