Molekulární architektura tranzientních interakcí v transkripční elongaci

Hledáme vysoce motivovaného/-ou doktoranda/-ku do Laboratoře strukturní biologie chromatinu, který/-á se bude zabývat studiem dynamických protein–proteinových interakcí regulujících transkripční elongaci.

Transkripce zprostředkovaná RNA polymerázou II je závislá na husté síti krátkodobých, avšak vysoce selektivních interakcí, které jsou zprostředkovány neuspořádanými oblastmi proteinů a krátkými lineárními motivy. Tyto interakce umožňují sestavení elongačních transkripčních komplexů na chromatinu, avšak jejich molekulární organizace zůstává dosud nedostatečně pochopena. Tento doktorský projekt se zaměří na řešení této zásadní otázky prostřednictvím studia proteinu IWS1, konzervovaného faktoru transkripční elongace, který funguje jako centrální interakční uzel.

Cílem projektu je objasnit, jak IWS1 organizuje a reguluje komplexy transkripční elongace prostřednictvím své modulární doménové struktury a neuspořádaných oblastí. Projekt bude zkoumat, jak dynamické multivalentní interakce ovlivňují výběr interakčních partnerů, kooperativitu a vazbu faktorů na chromatin. Pomocí integrativního přístupu strukturní biologie si projekt klade za cíl vytvořit mechanistický model popisující, jak přechodné interakce zajišťují rychlou a zároveň specifickou kontrolu transkripční elongace v kontextu chromatinu.

Studijní program: Vývojová a buněčná biologie