Mechanismy biogeneze a kontroly kvality membránových proteinů mezi translací a degradací

Membránové proteiny jsou klíčové pro funkci buňky, ale mechanismy zajišťující jejich proteostázu nejsou zcela objasněny. Nedávno byly objeveny nové insertázy proteinů a intramembránové chaperony, ale jejich klientské spektrum a související mechanismy kontroly kvality nebyly dosud pochopeny. Zjistili jsme, že UBAC2, pseudoproteáza z rodiny rhomboidů, asociuje s ER insertasami, chaperony a ribozomálními proteiny. UBAC2 je homologní s derliny, klíčovými složkami ERAD retrotranslokonu/ů, a byl již dříve asociován s ERADem a metabolismem lipidů. Pomocí proteomiky a buněčné biologie prozkoumáme spektrum klientů UBAC2 a podrobně charakterizujeme jeho interaktom, abychom pochopili jeho úlohu na rozhraní translace a degradace membránových proteinů. Tento přístup bude zahrnovat práci v kultivovaných buňkách, genetiku (CRISPR a RNAi), proteomiku a buněčně biologické techniky od mikroskopie až po biochemické přístupy in vitro s cílem objasnit základní principy homeostázy membránových proteinů v savčích buňkách. Cílem projektu je pochopit roli pseudoproteázy UBAC2 z rodiny rhomboidů v biogenezi nebo degradaci membránových proteinů v endoplazmatickém retikulu a odhalit tak obecnější principy, kterými se řídí membránová proteostáza.

Studijní program: Vývojová a buněčná biologie; Molekulární a buněčná biologie, genetika a virologie; Biochemie